Analyse PCR quantitative qPCR
PCR quantitative / PCR en temps réel
 
 
La PCR quantitative, qPCR ou PCR en temps réel permet de détecter la présence de quantités minuscules d'ADN d'un champignon dans un échantillon et, en outre, de les quantifier.
Cette technique de laboratoire a de nombreuses applications telles que la détection de champignons pathogènes dans une plante ou dans une structure en bois, ou encore la détection de champignons comme la truffe dans un échantillon de sol ainsi que de ses contaminants. La quantification nous permet de savoir où et à quel moment il y a plus de mycélium d'un champignon mycorhizien dans le sol, ce qui nous aide à comprendre son comportement. Cette technique a d'autres applications pratiques telles que les essais d'expression génique.
 
C'est notre processus de travail
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Recherche
APPROCHE
 
Nous travaillons sur différents projets dans le but de chercher des liens entre la quantité de mycélium dans le sol et la production de carpophores (champignons ou truffes). L'objectif est de définir un algorithme qui permette de prédire des productions de champignons de haute valeur à partir d'un échantillon de sol. Les écosystèmes dans lesquels nous travaillons sont les suivants : - Buissons de Cistus ladanifer producteurs de Boletus edulis. - Chênaies et plantations de Quercus ilex producteurs de Tuber melanosporum.
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Développement
APPROCHE
 
Les techniques de détection et de quantification par qPCR exigent des développements pour mettre au point une analyse répétitive et doivent être testées afin d'évaluer leur efficacité. C'est ainsi que IDForest a entrepris de mettre au point la technique de détection/quantification des champignons suivants: Tuber aestivum, Tuber brumale, Tuber indicum, Tuber borchii et Trichophaea woolhopeia.
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Innovation
APPROCHE
 
Après avoir réalisé les recherches et développements nécessaires, nous sommes en mesure aujourd'hui de fournir une série de services de détection et de quantification qui apportent des résultats de haute précision et d'une grande sécurité.
Produits et services
Service de détection et de quantification de Boletus (Boletus edulis).
1. Extraction d'ADN et amplification par qPCR du primer spécifique, et détection à l'aide de sondes TaqMan. 2. Évaluation des résultats d'amplification aussi bien pour la détection que pour la quantification en utilisant des moyens bioinformatiques.
Service de détection et de quantification du chancre résineux du pin (Fusarium circinatum).
1. Extraction d'ADN et amplification par qPCR du primer spécifique, et détection à l'aide de sondes TaqMan. 2. Évaluation des résultats d'amplification aussi bien pour la détection que pour la quantification en utilisant des moyens bioinformatiques.
De la recherche au produit
Parlons de votre projet